اگر به روند اختصاص بودجه‌هاي پژوهشي توسط دستگاه‌هاي مختلف توجه كنيم به نكته مهمي مي‌توان پي برد.مهدي زارع در وبلاگ خود نوشته است: بر روي كاغذ امكان و دستور براي پرداخت به - و سرمايه‌گذاري روي- طرح‌هاي پژوهشي ماموريت‌گرا و در جهت رفع مشكل وجود دارد، ولي عملا به قدري پيچيدگي‌هاي بوروكراتيك بر سر راه سرمايه‌گذاري‌هاي كلان در امر پژوهش وجود دارد - يا بوجود مي‌آيد!- كه عملا بسياري از بودجه‌هاي پژوهشي امكان مصرف شدن مستقيم در پروژه‌هاي پژوهشي را پيدا نمي‌كنند.